78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0079 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  100 
 
 
385 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  33.52 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  37.43 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  40.3 
 
 
363 aa  212  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  40.45 
 
 
383 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  38.08 
 
 
388 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  35.98 
 
 
364 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  38.05 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  36.86 
 
 
367 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  35.54 
 
 
380 aa  199  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  41.42 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  36.97 
 
 
367 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  36.14 
 
 
364 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  38.75 
 
 
380 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  36.78 
 
 
367 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  36.45 
 
 
369 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  36.45 
 
 
369 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  36.45 
 
 
369 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  36.45 
 
 
369 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  36.45 
 
 
369 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  36.45 
 
 
369 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  43.53 
 
 
366 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  34.05 
 
 
370 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  33.24 
 
 
368 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  38.36 
 
 
383 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  39.59 
 
 
384 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  46.7 
 
 
368 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  40.23 
 
 
366 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  43.17 
 
 
369 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  38.95 
 
 
346 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  37.78 
 
 
359 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  38.51 
 
 
371 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  37.18 
 
 
357 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  40 
 
 
257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  38.29 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  33 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  33 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  36.15 
 
 
360 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  36.15 
 
 
360 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  36.08 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  46.07 
 
 
269 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  37.07 
 
 
358 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  40.26 
 
 
361 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  37.3 
 
 
346 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  41.95 
 
 
364 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  35.77 
 
 
366 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  37.38 
 
 
358 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  33.68 
 
 
358 aa  176  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  49.22 
 
 
336 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  40 
 
 
377 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  34.22 
 
 
361 aa  163  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  35.04 
 
 
344 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  39.3 
 
 
369 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  39.3 
 
 
369 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  38.93 
 
 
371 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  39.3 
 
 
369 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  39.25 
 
 
369 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  35.47 
 
 
369 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  38.06 
 
 
389 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  35.85 
 
 
369 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  38.06 
 
 
385 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  38.26 
 
 
388 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  33.59 
 
 
331 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  42.15 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  44.38 
 
 
168 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  46.07 
 
 
361 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  39.13 
 
 
346 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  28.42 
 
 
658 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  34.06 
 
 
633 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  30.22 
 
 
630 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  29.71 
 
 
630 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  28.16 
 
 
631 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  28.23 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  29.71 
 
 
630 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  28.79 
 
 
655 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  39.58 
 
 
133 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  32.5 
 
 
602 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  29.6 
 
 
671 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>