18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0074 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0074  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3073  hypothetical protein  46.77 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.818118  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3300  hypothetical protein  46.77 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1879  transcriptional regulator  50 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00500027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2909  hypothetical protein  49.23 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2239  hypothetical protein  43.55 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000652309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16310  transcriptional regulator  43.55 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472686  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1960  transcriptional regulator  43.55 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.387495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5133  transcriptional regulator  43.55 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2272  transcriptional regulator  41.54 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2290  hypothetical protein  43.55 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000784834  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5971  transcriptional regulator  41.94 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2207  putative transcriptional regulator  40 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.404102  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2073  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2801  hypothetical protein  43.48 
 
 
68 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0678708  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1674  transcriptional regulator  40 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0860808  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3859  hypothetical protein  43.75 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.742903  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2177  resolvase domain-containing protein  57.58 
 
 
139 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000287507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>