20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0070 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0070  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  50.75 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  49.32 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  41.57 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  38.55 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  38.55 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  42.53 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  39.53 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  41.67 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  44.44 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  36.78 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  37.97 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  36.71 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  39.47 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  40.28 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  45.83 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  39.74 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>