139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0067 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  72.64 
 
 
277 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  70.75 
 
 
325 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  69.52 
 
 
145 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  70.48 
 
 
156 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  69.03 
 
 
141 aa  147  1e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  67.62 
 
 
128 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  60.33 
 
 
175 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  63.81 
 
 
161 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  63.81 
 
 
161 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  63.81 
 
 
161 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  65.38 
 
 
128 aa  135  6e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 
191 aa  135  7e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  62.39 
 
 
165 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  58.26 
 
 
176 aa  131  7e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  58.4 
 
 
183 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  59.13 
 
 
128 aa  130  1e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  59.65 
 
 
170 aa  131  1e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  60.95 
 
 
140 aa  131  1e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  60.95 
 
 
191 aa  130  2e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  57.02 
 
 
145 aa  126  2e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 
182 aa  127  2e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  61.82 
 
 
162 aa  121  1e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
156 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
117 aa  77  2e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.04 
 
 
132 aa  58.5  8e-08  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
223 aa  51.2  1e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  4.01895e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  41.79 
 
 
133 aa  50.4  3e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 
204 aa  48.5  9e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
105 aa  48.5  9e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  40.3 
 
 
133 aa  48.5  9e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.65574e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 
133 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.38688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  35.56 
 
 
191 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
71 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
101 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 
245 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
181 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
211 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
276 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 
197 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  43.64 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  46.3 
 
 
108 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.21 
 
 
104 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
129 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  32.79 
 
 
152 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
99 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
120 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.79 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  4.46905e-09 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.79 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.79 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
191 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.79 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
83 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 
154 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.44144e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
127 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  39.66 
 
 
203 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 
190 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
110 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.79 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.31765e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
126 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.75519e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  42.59 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
105 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
67 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  42.86 
 
 
428 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  40.98 
 
 
101 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
131 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
132 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  39.06 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  33.85 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
199 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 
428 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  40.68 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
181 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>