24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0064 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1721  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  33.95 
 
 
398 aa  73.9  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  72.8  3e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  72.4  4e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  25.51 
 
 
273 aa  68.2  6e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  23.87 
 
 
273 aa  65.9  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  31.75 
 
 
332 aa  65.1  6e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  26.38 
 
 
428 aa  64.7  6e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  26.47 
 
 
273 aa  64.7  7e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  32.64 
 
 
395 aa  63.5  1e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  24.05 
 
 
270 aa  62.8  3e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  24.33 
 
 
266 aa  55.8  4e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.93714e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7711  hypothetical protein  32.02 
 
 
280 aa  55.8  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  31.55 
 
 
383 aa  52.8  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  27.89 
 
 
424 aa  52.4  4e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  28.47 
 
 
379 aa  51.6  7e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  27.33 
 
 
604 aa  51.2  9e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  28.93 
 
 
268 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  28.12 
 
 
567 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  30.72 
 
 
366 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  31.33 
 
 
366 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  28.47 
 
 
592 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5887  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
762 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  31.01 
 
 
532 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>