More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0061 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  66.67 
 
 
137 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  58.33 
 
 
136 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 
136 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  55.91 
 
 
143 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  61.24 
 
 
144 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  55.12 
 
 
174 aa  150  6e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  60.61 
 
 
144 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  53.73 
 
 
139 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  50.35 
 
 
143 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  54.2 
 
 
144 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  46.51 
 
 
151 aa  117  4e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  51.88 
 
 
159 aa  114  4e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  42.11 
 
 
142 aa  109  1e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  42.31 
 
 
140 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  38.64 
 
 
138 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  37.98 
 
 
145 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  39.23 
 
 
142 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.38692e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  39.67 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.37 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  36.92 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 
173 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  38.64 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  40.77 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  32.56 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.56 
 
 
143 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 
144 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.37697e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  29.8 
 
 
154 aa  86.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.54751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 
135 aa  83.6  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 
147 aa  83.2  1e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  31.76 
 
 
167 aa  82.8  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 
155 aa  83.2  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
158 aa  83.2  1e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.37 
 
 
155 aa  82.8  1e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.54091e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.09 
 
 
143 aa  83.2  1e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
143 aa  83.2  1e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.64453e-12  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 
157 aa  82.4  2e-15  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 
157 aa  82.4  2e-15  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 
157 aa  82.4  2e-15  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  33.12 
 
 
167 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  33.12 
 
 
167 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.2 
 
 
154 aa  82  3e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  28.17 
 
 
145 aa  81.6  3e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  30.37 
 
 
155 aa  82  3e-15  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
150 aa  81.6  3e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 
152 aa  81.6  4e-15  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.93805e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
150 aa  80.9  5e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  34.06 
 
 
170 aa  80.9  5e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  29.66 
 
 
151 aa  80.9  5e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.12773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
153 aa  80.5  7e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.99535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
143 aa  80.5  8e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.2945e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
176 aa  80.5  8e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 
151 aa  80.1  9e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 
151 aa  80.1  9e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  29.66 
 
 
151 aa  80.1  9e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  5.72819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.44204e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
143 aa  80.1  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.56 
 
 
149 aa  80.1  1e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 
152 aa  80.1  1e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  8.32394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51163e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 
139 aa  79.7  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 
149 aa  80.1  1e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  79.7  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 
144 aa  79  2e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  32.12 
 
 
154 aa  79  2e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 
150 aa  77.8  4e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 
152 aa  78.2  4e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
149 aa  78.2  4e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.86 
 
 
143 aa  78.2  4e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  29.86 
 
 
164 aa  78.2  4e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 
152 aa  77.8  5e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.95 
 
 
145 aa  77.8  5e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.48432e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 
167 aa  77.4  7e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
152 aa  77  8e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.44475e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
148 aa  77  9e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  26.67 
 
 
155 aa  76.6  1e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  32.67 
 
 
168 aa  76.6  1e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  28.36 
 
 
151 aa  75.9  2e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  29.86 
 
 
164 aa  75.5  2e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
152 aa  75.1  3e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  29.1 
 
 
156 aa  75.1  3e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 
166 aa  75.1  3e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  28.37 
 
 
159 aa  75.1  3e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
146 aa  73.9  6e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  32.65 
 
 
154 aa  73.2  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  34.85 
 
 
130 aa  73.2  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
149 aa  73.2  1e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 
152 aa  72.4  2e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 
150 aa  72.4  2e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>