More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0056 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
418 aa  813  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.14 
 
 
451 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  44.73 
 
 
409 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.01 
 
 
389 aa  275  2e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.51 
 
 
395 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.57 
 
 
392 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.96 
 
 
421 aa  262  9e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.3 
 
 
422 aa  259  5e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  43.65 
 
 
394 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.95 
 
 
390 aa  254  2e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  42.52 
 
 
407 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.52 
 
 
407 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  42.52 
 
 
407 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  42.82 
 
 
391 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  41.79 
 
 
391 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.83 
 
 
425 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  38.73 
 
 
423 aa  221  1e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.93 
 
 
406 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.58 
 
 
371 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  28.9 
 
 
399 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  27.25 
 
 
394 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.1 
 
 
396 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  29.67 
 
 
391 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  26.67 
 
 
394 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.48 
 
 
385 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.17 
 
 
847 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.12 
 
 
602 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.4 
 
 
738 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.27 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  26.15 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  36.52 
 
 
688 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.22 
 
 
549 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  26.29 
 
 
394 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.85 
 
 
391 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  37.24 
 
 
676 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  37.55 
 
 
581 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
682 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.36 
 
 
412 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  25.91 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  24.86 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.61 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  25.67 
 
 
393 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.78 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  25.67 
 
 
393 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.67 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  25.22 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.79 
 
 
460 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.56 
 
 
384 aa  90.1  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.49084e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  25.22 
 
 
380 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.11 
 
 
746 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25.22 
 
 
380 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 
396 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
389 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
389 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  26.36 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  24.64 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  24.64 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
283 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  24.64 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  24.64 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.2098e-41 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  30.82 
 
 
378 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  24.64 
 
 
380 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 
456 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  28.77 
 
 
389 aa  87  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
492 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  24.71 
 
 
380 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.95 
 
 
384 aa  85.9  1e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  40.15 
 
 
492 aa  85.5  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  40.15 
 
 
492 aa  85.5  2e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  40.15 
 
 
492 aa  85.5  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  40.15 
 
 
492 aa  85.5  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  27.8 
 
 
423 aa  83.6  7e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  36.6 
 
 
576 aa  83.2  7e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 
377 aa  83.2  7e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  33.75 
 
 
488 aa  82.8  1e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  45.61 
 
 
291 aa  82.4  1e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  36.82 
 
 
1432 aa  82.8  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.93 
 
 
1087 aa  81.6  2e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.79 
 
 
389 aa  82  2e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.34 
 
 
523 aa  82  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  50 
 
 
463 aa  81.6  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
874 aa  81.6  2e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  36.22 
 
 
260 aa  82.4  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
644 aa  81.6  2e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 
378 aa  81.3  3e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  37 
 
 
757 aa  81.3  3e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 
357 aa  80.9  4e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
659 aa  80.9  4e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
404 aa  80.5  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
759 aa  80.1  6e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.33 
 
 
532 aa  80.1  6e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  32.74 
 
 
309 aa  80.1  7e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
634 aa  80.1  7e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  27.95 
 
 
434 aa  80.1  7e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  50 
 
 
463 aa  80.1  7e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  50 
 
 
463 aa  80.1  7e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 
579 aa  79.7  8e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.05 
 
 
1087 aa  79.7  9e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
553 aa  79  1e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>