More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0052 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1669  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.11 
 
 
560 aa  664  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4714  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.02 
 
 
628 aa  864  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.35194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.03 
 
 
631 aa  841  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.04 
 
 
681 aa  818  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3175  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.83 
 
 
611 aa  820  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4975  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.18 
 
 
626 aa  861  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.52 
 
 
586 aa  880  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1610  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.38 
 
 
630 aa  769  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0307755  normal  0.0806317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0455  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.14 
 
 
681 aa  816  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  5.71171e-06 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0437  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.09 
 
 
548 aa  709  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.753273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2081  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.05 
 
 
643 aa  868  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.78 
 
 
647 aa  857  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2439  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.19 
 
 
707 aa  801  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4080  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.21 
 
 
602 aa  824  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.902816  normal  0.090011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3185  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.87 
 
 
628 aa  772  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0350436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2592  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.48 
 
 
652 aa  834  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1195  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.57 
 
 
643 aa  862  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.188693  normal  0.242817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1629  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.87 
 
 
630 aa  775  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984407  normal  0.732533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.82 
 
 
625 aa  854  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.13 
 
 
635 aa  822  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2670  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.35 
 
 
643 aa  852  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381108  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.71 
 
 
631 aa  837  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1840  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.76 
 
 
607 aa  644  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.170642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1518  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.41 
 
 
643 aa  864  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154011  normal  0.829853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0063  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.89 
 
 
614 aa  764  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0958  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.92 
 
 
618 aa  768  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1105  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.57 
 
 
643 aa  863  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.324786  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2430  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.38 
 
 
628 aa  851  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1077  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.02 
 
 
618 aa  770  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.017294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3206  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.36 
 
 
627 aa  772  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3877  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.21 
 
 
602 aa  824  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339373 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3681  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.21 
 
 
602 aa  824  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
680 aa  840  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4174  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.98 
 
 
610 aa  810  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772115  normal  0.0881714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10428  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.59 
 
 
547 aa  760  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00121704  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.02 
 
 
666 aa  853  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.18 
 
 
626 aa  865  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3201  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.05 
 
 
619 aa  827  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.814938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6226  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.03 
 
 
633 aa  804  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642096  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0965  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.94 
 
 
606 aa  776  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.831801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2452  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.88 
 
 
645 aa  825  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.39 
 
 
607 aa  830  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.85 
 
 
627 aa  866  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1922  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.32 
 
 
712 aa  799  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.56 
 
 
630 aa  840  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  70 
 
 
627 aa  880  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2323  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.19 
 
 
707 aa  801  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.31 
 
 
586 aa  899  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.58 
 
 
530 aa  827  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.9 
 
 
606 aa  974  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2383  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.36 
 
 
667 aa  818  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0284  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.4 
 
 
647 aa  836  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2013  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.72 
 
 
652 aa  820  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715705  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4536  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.03 
 
 
631 aa  841  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4228  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.03 
 
 
631 aa  840  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00366  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.04 
 
 
646 aa  843  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1749  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.27 
 
 
554 aa  713  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3515  thiamine biosynthesis protein ThiC  67 
 
 
624 aa  825  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.294896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2149  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.56 
 
 
623 aa  798  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3853  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.09 
 
 
681 aa  819  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.54 
 
 
631 aa  838  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.58 
 
 
530 aa  828  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.91 
 
 
917 aa  723  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.72 
 
 
564 aa  813  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.75 
 
 
548 aa  835  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0621  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.19 
 
 
609 aa  841  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  75.87 
 
 
601 aa  911  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.05 
 
 
547 aa  817  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.93 
 
 
630 aa  852  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0216  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.94 
 
 
651 aa  835  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.75 
 
 
655 aa  848  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  66.03 
 
 
631 aa  841  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3715  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.83 
 
 
650 aa  819  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.13 
 
 
635 aa  822  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.13 
 
 
607 aa  773  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.68 
 
 
573 aa  884  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4728  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.43 
 
 
628 aa  860  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  69.04 
 
 
554 aa  749  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.36 
 
 
573 aa  865  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.1 
 
 
562 aa  847  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3737  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.93 
 
 
566 aa  758  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.871211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.25 
 
 
516 aa  808  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.21 
 
 
629 aa  827  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0892  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.81 
 
 
885 aa  735  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.12 
 
 
587 aa  780  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.01 
 
 
622 aa  832  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.96 
 
 
578 aa  964  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.29 
 
 
627 aa  851  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002072  thiamin biosynthesis protein ThiC  67.2 
 
 
646 aa  848  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.3 
 
 
568 aa  773  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.93 
 
 
567 aa  800  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0500  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.02 
 
 
629 aa  850  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0220  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.19 
 
 
646 aa  834  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.464551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44600  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.36 
 
 
628 aa  860  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.95 
 
 
614 aa  843  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5462  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.87 
 
 
631 aa  841  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.416651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2983  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.36 
 
 
648 aa  837  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.56 
 
 
627 aa  825  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.29 
 
 
631 aa  843  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.4 
 
 
631 aa  843  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>