299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0051 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  48.92 
 
 
333 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  44.12 
 
 
243 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  50.44 
 
 
293 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  42.08 
 
 
237 aa  147  2e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  40.1 
 
 
284 aa  129  4e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  40.93 
 
 
284 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  29.55 
 
 
280 aa  114  1e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  35.84 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  32.26 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  47.14 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.47 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 
335 aa  92.8  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  25.69 
 
 
336 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  36.18 
 
 
337 aa  88.6  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  38.67 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  42.14 
 
 
316 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
347 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  38.82 
 
 
331 aa  85.9  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  37.01 
 
 
306 aa  85.1  1e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  43.57 
 
 
304 aa  84.7  1e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  36.75 
 
 
299 aa  84  2e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  24.74 
 
 
350 aa  83.6  3e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 
351 aa  82.8  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  39.47 
 
 
298 aa  82.8  5e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  41.43 
 
 
300 aa  82  8e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.69 
 
 
342 aa  81.6  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  40.71 
 
 
300 aa  80.1  3e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.76 
 
 
363 aa  80.1  3e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.13 
 
 
339 aa  80.1  4e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  35.47 
 
 
239 aa  79.3  5e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 
332 aa  79.3  5e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  26.77 
 
 
330 aa  79.3  6e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  26.55 
 
 
348 aa  79  7e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  35.76 
 
 
312 aa  79  7e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
300 aa  77.8  1e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  38.85 
 
 
275 aa  77.4  2e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  35.9 
 
 
320 aa  77.4  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
353 aa  77.8  2e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.39 
 
 
313 aa  77  2e-13  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  26.59 
 
 
308 aa  76.6  4e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.56 
 
 
310 aa  76.6  4e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 
345 aa  75.9  6e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.81 
 
 
336 aa  75.1  9e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 
337 aa  75.1  1e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  32.59 
 
 
345 aa  73.9  2e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 
302 aa  73.6  3e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.73 
 
 
386 aa  73.6  3e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  37.86 
 
 
301 aa  73.6  3e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  37.86 
 
 
302 aa  73.6  3e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  37.86 
 
 
301 aa  73.2  4e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  37.86 
 
 
301 aa  73.2  4e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  26.88 
 
 
338 aa  72.8  5e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 
333 aa  72.8  5e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  41.28 
 
 
347 aa  72.8  5e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  37.33 
 
 
275 aa  72.4  7e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 
345 aa  72  9e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
369 aa  72  9e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.57 
 
 
337 aa  71.2  2e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 
344 aa  70.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 
374 aa  69.7  4e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  26.52 
 
 
355 aa  70.1  4e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 
310 aa  69.7  4e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  33.16 
 
 
305 aa  69.7  5e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  28.67 
 
 
331 aa  69.7  5e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  25.27 
 
 
336 aa  69.7  5e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  32.85 
 
 
335 aa  69.3  6e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.13 
 
 
360 aa  68.9  8e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  28.33 
 
 
302 aa  68.6  9e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  35.21 
 
 
344 aa  68.6  9e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  28.33 
 
 
368 aa  68.6  9e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  23.81 
 
 
348 aa  68.2  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  22.14 
 
 
309 aa  68.2  1e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  26.67 
 
 
344 aa  67.8  1e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.26725e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  35.33 
 
 
330 aa  67.8  1e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  23.81 
 
 
348 aa  68.2  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  23.81 
 
 
348 aa  68.2  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  32.84 
 
 
315 aa  68.2  1e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  23.81 
 
 
348 aa  68.2  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.73 
 
 
381 aa  68.2  1e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 
374 aa  68.6  1e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  36.36 
 
 
305 aa  67.8  1e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.67 
 
 
350 aa  67.4  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.62 
 
 
330 aa  67.8  2e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  38.16 
 
 
297 aa  67.4  2e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  24.38 
 
 
317 aa  67.4  2e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 
374 aa  67.4  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  31.62 
 
 
327 aa  67.4  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  36.92 
 
 
800 aa  67.4  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.67 
 
 
350 aa  67.4  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 
321 aa  67  3e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  26.78 
 
 
362 aa  67  3e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.67 
 
 
350 aa  67  3e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 
365 aa  67  3e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.45 
 
 
351 aa  67  3e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 
351 aa  67  3e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.45 
 
 
351 aa  67  3e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  29.45 
 
 
351 aa  67  3e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.45 
 
 
351 aa  67  3e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.68 
 
 
338 aa  67  3e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>