More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0045 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  100 
 
 
417 aa  789  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  54.4 
 
 
402 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  55.1 
 
 
393 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  56.18 
 
 
403 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  56.18 
 
 
403 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  56.18 
 
 
403 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  56.91 
 
 
406 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  54.34 
 
 
402 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  57.58 
 
 
404 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  57.21 
 
 
416 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  55.18 
 
 
408 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  58.31 
 
 
440 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 
407 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  53.4 
 
 
446 aa  353  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  55.18 
 
 
407 aa  337  3e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  51.8 
 
 
565 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  48.59 
 
 
568 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  50.27 
 
 
412 aa  316  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  6.37715e-05 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  51.91 
 
 
431 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 
386 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 
422 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  53.37 
 
 
424 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 
428 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  38.86 
 
 
387 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  38.86 
 
 
387 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  38.86 
 
 
387 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  38.86 
 
 
387 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  39.5 
 
 
387 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  38.75 
 
 
387 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  38.59 
 
 
387 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  38.75 
 
 
387 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  38.24 
 
 
387 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  38.24 
 
 
387 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  39.22 
 
 
381 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
385 aa  222  1e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  44.05 
 
 
368 aa  199  1e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
402 aa  166  1e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
393 aa  81.3  3e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
393 aa  81.3  3e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
393 aa  76.6  7e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.5 
 
 
393 aa  76.6  8e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  25.54 
 
 
392 aa  75.9  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.67 
 
 
416 aa  75.1  2e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 
512 aa  74.7  3e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
512 aa  73.9  5e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 
485 aa  73.2  8e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
393 aa  73.2  8e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
478 aa  72.8  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
509 aa  72.4  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
517 aa  72.8  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
508 aa  72  2e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
393 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
393 aa  72.4  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
491 aa  70.9  4e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
493 aa  70.5  5e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.51 
 
 
426 aa  69.7  9e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.18 
 
 
526 aa  69.7  1e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 
511 aa  69.7  1e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  29.29 
 
 
400 aa  68.2  2e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  27.18 
 
 
526 aa  68.2  2e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
476 aa  68.2  3e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  23.24 
 
 
393 aa  67.4  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  31.29 
 
 
406 aa  67  5e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 
509 aa  66.6  7e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 
510 aa  66.2  1e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 
486 aa  65.9  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 
478 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
460 aa  65.9  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 
486 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 
514 aa  66.2  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 
486 aa  65.9  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
502 aa  65.9  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 
486 aa  65.9  1e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 
486 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 
486 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.26 
 
 
478 aa  65.1  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.54 
 
 
520 aa  65.5  2e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
511 aa  65.5  2e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.35 
 
 
534 aa  65.1  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 
478 aa  64.7  3e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  22.4 
 
 
394 aa  64.3  4e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 
511 aa  64.3  4e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
392 aa  63.5  6e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
462 aa  63.5  6e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.56 
 
 
522 aa  63.9  6e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.5 
 
 
525 aa  63.5  7e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.11 
 
 
515 aa  63.5  7e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.72 
 
 
440 aa  63.2  8e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
387 aa  63.2  8e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.58317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 
525 aa  63.2  8e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  5.37278e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 
512 aa  63.2  9e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
579 aa  62.8  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.02 
 
 
425 aa  62.8  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  30.64 
 
 
528 aa  62.8  1e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 
515 aa  62.4  1e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.8 
 
 
424 aa  62.4  1e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.35 
 
 
409 aa  62.4  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 
513 aa  62.4  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.1 
 
 
418 aa  62.4  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 
499 aa  61.6  2e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  7.74883e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>