255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0044 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  374  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  45 
 
 
171 aa  79.7  3e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
147 aa  75.9  4e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
155 aa  73.6  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
155 aa  73.6  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
155 aa  73.6  2e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
142 aa  72.4  4e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
149 aa  71.6  6e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
143 aa  69.7  2e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  39.81 
 
 
149 aa  69.7  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
142 aa  67.8  1e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  41.88 
 
 
163 aa  67  1e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
149 aa  66.6  2e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
127 aa  67  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
139 aa  66.2  3e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
157 aa  64.7  9e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
141 aa  63.5  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
146 aa  63.9  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
139 aa  62.8  3e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.37 
 
 
138 aa  62.4  4e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  43.69 
 
 
157 aa  62.4  4e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  60.1  2e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  39.77 
 
 
159 aa  59.3  4e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
143 aa  58.9  5e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 
161 aa  57.8  9e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
147 aa  57.8  9e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 
163 aa  57.8  9e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
161 aa  57.4  1e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  37.86 
 
 
161 aa  57.8  1e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  57  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
165 aa  57  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  57  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  57  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
163 aa  56.2  3e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.72 
 
 
163 aa  55.8  4e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
146 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
158 aa  55.5  5e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 
151 aa  55.1  6e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
208 aa  55.1  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 
152 aa  54.7  7e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
144 aa  54.3  1e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
151 aa  54.3  1e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  47.14 
 
 
153 aa  53.9  1e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
151 aa  54.3  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
158 aa  53.5  2e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.57721e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.65 
 
 
153 aa  53.1  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
143 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
162 aa  53.1  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
149 aa  53.9  2e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
159 aa  53.9  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
145 aa  53.5  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
146 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 
154 aa  52.8  3e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
200 aa  52.4  4e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
148 aa  52.4  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
219 aa  52.4  4e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
147 aa  52  5e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
150 aa  52  5e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
151 aa  52  6e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  36.84 
 
 
145 aa  52  6e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
159 aa  51.6  6e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.37 
 
 
157 aa  51.6  7e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 
138 aa  51.6  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
172 aa  51.2  9e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
303 aa  51.2  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
165 aa  50.8  1e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.54878e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
147 aa  50.4  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
156 aa  49.7  2e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.18752e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
143 aa  50.4  2e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
144 aa  50.1  2e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
146 aa  50.4  2e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
178 aa  50.1  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 
135 aa  49.3  3e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
146 aa  49.7  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
155 aa  49.7  3e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
173 aa  49.3  3e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
164 aa  49.3  3e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
171 aa  49.3  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
153 aa  49.3  3e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
152 aa  49.3  3e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
171 aa  49.3  3e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 
164 aa  49.3  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.18689e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
175 aa  49.3  4e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
202 aa  48.9  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.38 
 
 
156 aa  48.5  5e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  48.9  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
145 aa  48.5  6e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 
166 aa  48.1  7e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
140 aa  48.1  8e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
173 aa  48.1  8e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>