More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0041 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
587 aa  1150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  58.51 
 
 
600 aa  447  1e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  55.48 
 
 
626 aa  408  1e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  43.6 
 
 
584 aa  299  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  42.77 
 
 
615 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  43.23 
 
 
669 aa  280  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  40.98 
 
 
606 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.22 
 
 
582 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  38.19 
 
 
608 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31422e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  34.66 
 
 
614 aa  244  4e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  34.39 
 
 
613 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  37.98 
 
 
597 aa  238  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  39.74 
 
 
629 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  39.51 
 
 
456 aa  233  7e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  38.06 
 
 
470 aa  230  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  35.01 
 
 
613 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  37.5 
 
 
627 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  36.31 
 
 
598 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  5.4528e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.99 
 
 
580 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  31.89 
 
 
543 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  35.2 
 
 
631 aa  216  1e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.94 
 
 
575 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  35.7 
 
 
402 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  33.91 
 
 
577 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  36.26 
 
 
627 aa  202  2e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  36.91 
 
 
624 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  32.59 
 
 
564 aa  199  1e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  37.05 
 
 
628 aa  198  2e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  31.64 
 
 
562 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.5 
 
 
569 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.88 
 
 
620 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.69 
 
 
598 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.54 
 
 
565 aa  193  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  37.6 
 
 
615 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  32.62 
 
 
579 aa  189  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  37.6 
 
 
590 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.92 
 
 
754 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.04 
 
 
461 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 
589 aa  184  4e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.79 
 
 
589 aa  184  4e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.53 
 
 
591 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.53 
 
 
591 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.71 
 
 
591 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  30.17 
 
 
603 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  32.03 
 
 
464 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  33.71 
 
 
544 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.36 
 
 
589 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 
636 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  32.03 
 
 
464 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.62 
 
 
579 aa  181  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.62 
 
 
579 aa  181  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.62 
 
 
579 aa  181  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.49 
 
 
628 aa  181  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.54 
 
 
593 aa  181  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.54 
 
 
593 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  37.04 
 
 
625 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  33.07 
 
 
633 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.72 
 
 
589 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.1 
 
 
612 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.82 
 
 
577 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  32.64 
 
 
462 aa  174  3e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  34.6 
 
 
575 aa  174  3e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  34.53 
 
 
595 aa  174  4e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.98 
 
 
594 aa  173  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  36.22 
 
 
527 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  33.73 
 
 
638 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.15 
 
 
595 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  31.69 
 
 
600 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  36 
 
 
591 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  33.19 
 
 
461 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  33.19 
 
 
461 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  31.36 
 
 
606 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  31.98 
 
 
595 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.98 
 
 
595 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  31.98 
 
 
595 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  33.91 
 
 
595 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  35.36 
 
 
651 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  30.72 
 
 
604 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  29.34 
 
 
585 aa  168  3e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.03 
 
 
602 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 
595 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.72 
 
 
640 aa  167  6e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  33.75 
 
 
457 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  33.75 
 
 
475 aa  166  1e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  35.28 
 
 
473 aa  165  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  35.28 
 
 
473 aa  166  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  31.24 
 
 
603 aa  165  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  35.28 
 
 
473 aa  166  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  35.28 
 
 
473 aa  166  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  32.21 
 
 
605 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  35.28 
 
 
473 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  35.97 
 
 
593 aa  164  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  34.17 
 
 
466 aa  164  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.63 
 
 
863 aa  163  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  31.63 
 
 
605 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.68 
 
 
590 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  33.25 
 
 
586 aa  162  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.5 
 
 
859 aa  160  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  34.38 
 
 
478 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  34.38 
 
 
478 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>