More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0032 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  100 
 
 
327 aa  657  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  74.46 
 
 
329 aa  514  1e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  73.85 
 
 
329 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  75.54 
 
 
324 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  72.42 
 
 
388 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  73.09 
 
 
327 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  72.51 
 
 
353 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  75.94 
 
 
335 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  69.44 
 
 
327 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  70.46 
 
 
326 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  69.75 
 
 
331 aa  459  1e-128  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  71.08 
 
 
326 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  69.14 
 
 
340 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  69.82 
 
 
357 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  65.85 
 
 
357 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  66.15 
 
 
342 aa  444  1e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  68.4 
 
 
327 aa  445  1e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  66.67 
 
 
326 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  67.08 
 
 
328 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  59.62 
 
 
393 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  67.9 
 
 
345 aa  434  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  63.89 
 
 
329 aa  434  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  68.2 
 
 
345 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  63.61 
 
 
326 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  63.36 
 
 
335 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  70.45 
 
 
308 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  64.22 
 
 
326 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.42 
 
 
330 aa  424  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  61.66 
 
 
336 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  63.24 
 
 
706 aa  416  1e-115  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  62.27 
 
 
336 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79702e-11 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  62.15 
 
 
338 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.42 
 
 
343 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.18 
 
 
355 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  56.79 
 
 
339 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  54.97 
 
 
344 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  58.23 
 
 
325 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  58.81 
 
 
334 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  56.07 
 
 
325 aa  361  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  55.79 
 
 
370 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  57.37 
 
 
330 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  55.69 
 
 
329 aa  352  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  54.85 
 
 
373 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  54.8 
 
 
351 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  56.66 
 
 
349 aa  345  9e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  56.66 
 
 
349 aa  345  9e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  56.66 
 
 
349 aa  345  9e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  50.61 
 
 
354 aa  338  6e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  53.09 
 
 
348 aa  336  3e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.36909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  54.63 
 
 
334 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  54.63 
 
 
334 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  53.35 
 
 
324 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  53.35 
 
 
324 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.74 
 
 
324 aa  327  1e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  54.41 
 
 
324 aa  327  1e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  51.63 
 
 
349 aa  321  9e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  51.07 
 
 
325 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  50.47 
 
 
342 aa  307  2e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  50.62 
 
 
335 aa  306  2e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  48.3 
 
 
322 aa  305  5e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.11 
 
 
351 aa  305  5e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  49.7 
 
 
326 aa  305  9e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.24 
 
 
337 aa  304  1e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  49.69 
 
 
325 aa  303  2e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  45.73 
 
 
325 aa  303  2e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  50.31 
 
 
326 aa  303  2e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  50.92 
 
 
326 aa  303  2e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  49.27 
 
 
337 aa  304  2e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.24 
 
 
337 aa  303  2e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  47.42 
 
 
326 aa  303  3e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  52.17 
 
 
326 aa  302  6e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  45.51 
 
 
320 aa  301  8e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  49.69 
 
 
332 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  49.84 
 
 
336 aa  299  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  48.78 
 
 
326 aa  299  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  51.83 
 
 
326 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.07 
 
 
337 aa  298  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  47.72 
 
 
325 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.07 
 
 
341 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  47.56 
 
 
326 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.67 
 
 
337 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  48.41 
 
 
355 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  49.53 
 
 
326 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  48.52 
 
 
338 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  49.38 
 
 
323 aa  292  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  48.93 
 
 
333 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.62 
 
 
346 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  48.93 
 
 
328 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  46.2 
 
 
325 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  48.62 
 
 
333 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  46.04 
 
 
326 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  46.93 
 
 
324 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  52.44 
 
 
326 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  46.04 
 
 
326 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.75 
 
 
325 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.62 
 
 
347 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.62 
 
 
347 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  47.26 
 
 
346 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.62 
 
 
347 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.62 
 
 
347 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>