More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0029 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
555 aa  1107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  56.31 
 
 
522 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 
519 aa  273  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
537 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
530 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 
543 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
516 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
537 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
576 aa  253  5e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 
547 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.15 
 
 
532 aa  245  1e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
531 aa  245  2e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
552 aa  245  2e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.98 
 
 
545 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 
546 aa  243  4e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
525 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
591 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
536 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.2 
 
 
517 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
543 aa  240  6e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
568 aa  239  7e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
574 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 
567 aa  237  5e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 
543 aa  235  2e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
600 aa  234  2e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
605 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
564 aa  233  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
542 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
525 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
539 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
518 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 
579 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 
569 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 
532 aa  228  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
579 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
532 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
524 aa  226  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
529 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
577 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
519 aa  223  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
578 aa  223  1e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 
583 aa  223  1e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
557 aa  222  2e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
579 aa  222  2e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
556 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
573 aa  221  4e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
554 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
519 aa  220  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 
603 aa  220  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
639 aa  220  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 
572 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
545 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.77 
 
 
557 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
566 aa  218  3e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 
584 aa  216  6e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  28.8 
 
 
520 aa  215  2e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
582 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.45 
 
 
573 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.54105e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
552 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.05669e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
548 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 
595 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.45 
 
 
557 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
528 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
557 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
582 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 
574 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 
534 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
587 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
603 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
582 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
533 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
567 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  35.07 
 
 
560 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.05869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
585 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.79 
 
 
560 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.79 
 
 
560 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.79 
 
 
560 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.79 
 
 
560 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.88189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
554 aa  207  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
560 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.27543e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.52 
 
 
560 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.53053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.68 
 
 
560 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.59546e-08  hitchhiker  7.4562e-08 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.52 
 
 
560 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.04459e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
573 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.52 
 
 
560 aa  204  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 
546 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
582 aa  203  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  30.71 
 
 
543 aa  202  1e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 
540 aa  200  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  32.69 
 
 
562 aa  199  8e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
559 aa  198  2e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  31.63 
 
 
700 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.24 
 
 
551 aa  197  5e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
575 aa  196  8e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  35.23 
 
 
602 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
583 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
495 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
576 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  34.3 
 
 
559 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>