53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0004 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  322  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.94 
 
 
196 aa  120  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  39.64 
 
 
185 aa  113  1e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.15 
 
 
187 aa  111  4e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  44.83 
 
 
173 aa  111  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  38.6 
 
 
185 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  40.15 
 
 
187 aa  107  9e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  37.04 
 
 
190 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  37.04 
 
 
190 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  37.04 
 
 
190 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  42.03 
 
 
166 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  36.63 
 
 
188 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  46.55 
 
 
273 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  36.8 
 
 
196 aa  104  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  39.52 
 
 
188 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  38.36 
 
 
180 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  37.13 
 
 
185 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  45.69 
 
 
207 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  45.69 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  41.3 
 
 
217 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  43.1 
 
 
177 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  44.44 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  42.67 
 
 
183 aa  94.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  39.47 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  43.22 
 
 
206 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  42.99 
 
 
134 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  43.97 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  40.28 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.27 
 
 
266 aa  88.2  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.97 
 
 
217 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  41.32 
 
 
201 aa  87.8  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  37.99 
 
 
198 aa  84.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  38.18 
 
 
173 aa  79.7  2e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  36.89 
 
 
171 aa  71.6  4e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  33.94 
 
 
172 aa  70.5  8e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30.71 
 
 
155 aa  68.9  3e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  36.17 
 
 
117 aa  62  3e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  34.38 
 
 
156 aa  59.7  2e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  48.5  4e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  32.39 
 
 
101 aa  47.8  7e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  31.15 
 
 
101 aa  47.4  9e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  29.17 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  30.19 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  38.1 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  38.71 
 
 
159 aa  43.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  31.75 
 
 
151 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  35.29 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  29.52 
 
 
150 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  9.90571e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  31.75 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0672  hypothetical protein  24 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  25.27 
 
 
96 aa  40.8  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>