40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0003 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0013  tRNA-Ala  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0697084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  89.19 
 
 
72 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  89.19 
 
 
72 bp  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  89.19 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  89.19 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  92.45 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  86.49 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  92.68 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  90.91 
 
 
72 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  96.77 
 
 
72 bp  54  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  96.77 
 
 
72 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  96.77 
 
 
72 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  87.76 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  90.24 
 
 
78 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  91.43 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  93.55 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  93.33 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    93.33 
 
 
203 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>