More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1519 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  100 
 
 
87 aa  173  6e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.62554e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  54.88 
 
 
90 aa  87  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  56.79 
 
 
86 aa  82.8  1e-15  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  55.56 
 
 
86 aa  80.5  7e-15  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  54.67 
 
 
82 aa  77  7e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  53.33 
 
 
81 aa  76.3  1e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  45.24 
 
 
87 aa  75.5  2e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  54.67 
 
 
81 aa  75.1  3e-13  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  50.62 
 
 
86 aa  75.1  3e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  50.62 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  50.62 
 
 
86 aa  74.3  5e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  53.33 
 
 
81 aa  73.9  6e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  38.1 
 
 
88 aa  72.8  2e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  43.37 
 
 
84 aa  70.9  5e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  39.76 
 
 
84 aa  70.5  7e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  44.16 
 
 
83 aa  70.5  8e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  48.05 
 
 
82 aa  70.1  9e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  46.05 
 
 
82 aa  68.9  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 
100 aa  65.1  3e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  42.86 
 
 
82 aa  65.1  3e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.99035e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 
85 aa  64.7  4e-10  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  51.79 
 
 
93 aa  64.3  5e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  45.12 
 
 
82 aa  64.3  5e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  47.95 
 
 
100 aa  63.9  6e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  39.47 
 
 
82 aa  61.6  3e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 
98 aa  60.8  6e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 
84 aa  60.8  6e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  43.24 
 
 
81 aa  59.7  1e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  2.49681e-09  unclonable  3.35999e-07 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  44.16 
 
 
98 aa  60.1  1e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  39.33 
 
 
100 aa  58.5  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.96 
 
 
121 aa  58.2  3e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
100 aa  58.5  3e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  37.23 
 
 
100 aa  58.5  3e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  7.19358e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  43.66 
 
 
96 aa  57.4  7e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
95 aa  57  8e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  43.24 
 
 
99 aa  57  9e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  39.51 
 
 
98 aa  57  9e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  38.37 
 
 
95 aa  56.6  1e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  45.07 
 
 
103 aa  56.6  1e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  50.85 
 
 
96 aa  56.2  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  43.59 
 
 
102 aa  56.6  1e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 
96 aa  56.2  1e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 
101 aa  56.6  1e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  50.67 
 
 
81 aa  57  1e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  46.03 
 
 
99 aa  56.6  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  40.28 
 
 
100 aa  55.5  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.67938e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
100 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
100 aa  55.8  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  40 
 
 
154 aa  55.8  2e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  42.68 
 
 
95 aa  55.5  2e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  41.18 
 
 
94 aa  55.5  2e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
100 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  43.37 
 
 
102 aa  55.5  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.37619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
100 aa  55.5  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.72317e-09  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  40.96 
 
 
104 aa  55.1  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.25919e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.92959e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  38.96 
 
 
82 aa  54.7  4e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.25733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  8.0861e-06  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  55.1  4e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.47098e-06  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  5e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.8697e-06  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  5e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.57762e-07  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
94 aa  54.3  5e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.93915e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  43.66 
 
 
98 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 
100 aa  53.9  6e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
100 aa  53.9  7e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.25205e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  43.66 
 
 
98 aa  53.9  7e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  43.66 
 
 
98 aa  53.9  7e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 
94 aa  53.9  8e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
101 aa  53.9  8e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.18285e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  39.13 
 
 
101 aa  53.5  8e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  5.94054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  39.29 
 
 
98 aa  53.5  9e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  6.00083e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
101 aa  53.5  9e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
101 aa  53.5  9e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
101 aa  53.5  9e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.98801e-06  unclonable  1.84888e-11 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  1.9112e-08  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 
96 aa  53.1  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  42.25 
 
 
98 aa  53.5  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  1.64588e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  36.84 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
103 aa  52.4  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  6.27291e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  47.27 
 
 
97 aa  52.8  2e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  41.07 
 
 
101 aa  52.4  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.51497e-07  unclonable  7.70372e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>