More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1517 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  100 
 
 
151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  52.59 
 
 
137 aa  152  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  61.11 
 
 
136 aa  152  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  55.38 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  52.63 
 
 
140 aa  150  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  52.99 
 
 
141 aa  147  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  54.76 
 
 
136 aa  147  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  54.61 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  48.89 
 
 
139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  52.63 
 
 
140 aa  142  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  47.41 
 
 
137 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  49.21 
 
 
137 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  47.41 
 
 
137 aa  140  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  50.77 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  51.09 
 
 
136 aa  137  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  50.77 
 
 
140 aa  135  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  43.83 
 
 
162 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  42.86 
 
 
161 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  42.86 
 
 
161 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  42.86 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  52.31 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  40.74 
 
 
182 aa  125  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  53.23 
 
 
159 aa  124  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  53.23 
 
 
160 aa  122  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  51.61 
 
 
158 aa  120  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  48.46 
 
 
131 aa  120  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  51.61 
 
 
158 aa  120  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  43.18 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  40.94 
 
 
147 aa  117  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  47.62 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  45.19 
 
 
163 aa  110  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  41.04 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  44.03 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  40.19 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  43.21 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  48.33 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  44.71 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  53.33 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  56.14 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  46.05 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  52.63 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  43.37 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  50.85 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  56.14 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  45 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  57.89 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  44.74 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  42.5 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  47.56 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  44.74 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  45.78 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  54.39 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  43.37 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  44.16 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  49.15 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  44.58 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  52.63 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  48.15 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  45.33 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>