292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1512 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  65.69 
 
 		 106 aa  153  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  66.67 
 
 		 108 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  63.81 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  61.76 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  58.82 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  63.46 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  63.46 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  63.46 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  63.46 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  59.8 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  60.78 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  54.29 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  58.82 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  50.93 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  54.55 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  52.48 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  52.83 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  48.08 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  43.14 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  44.34 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  51.92 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  42.99 
 
 		 155 aa  95.9  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  44.76 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.12 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  48.15 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  51.89 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  42.34 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  56.47 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  51.89 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  51.89 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  50 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  44.16 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  41.56 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  43.04 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  44 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  45.57 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  44 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  40.26 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  44.62 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  34 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  38.75 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  44 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  49.18 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  44.19 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  44.19 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  43.84 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  34.65 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  40.51 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  40.51 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  42.47 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  39.73 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  38.1 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  32.91 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  40.51 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  38.67 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  41.03 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  37.66 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  35.23 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  43.04 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  36.9 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  38.55 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  46.38 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  41.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  43.48 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  36.9 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  35.9 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  46.38 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>