More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1420 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  100 
 
 		 360 aa  746    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  44.92 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  44.92 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  41.64 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  41.36 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  41.38 
 
 		 355 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  40 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  41.41 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  41.64 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  41.62 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  42.37 
 
 		 358 aa  279  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  41.64 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  40.56 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  41.06 
 
 		 370 aa  272  6e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  40.85 
 
 		 370 aa  272  8.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  40.45 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  39.54 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.15 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  37.36 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.71 
 
 		 382 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.71 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.71 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.71 
 
 		 383 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.7 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  35.21 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  34.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.26 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  32 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  31.51 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.9 
 
 		 377 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.87 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.49 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.62 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  35.37 
 
 		 382 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  34.62 
 
 		 360 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.47 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.17 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.56 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.51 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  31.28 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.39 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  33.06 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.39 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.87 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.7 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.87 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.69 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.15 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  31.81 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.42 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  34.43 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.9 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.25 
 
 		 387 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  29.81 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  29.32 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  29.32 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  31.88 
 
 		 380 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.15 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  31.22 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  29.53 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  30.58 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.35 
 
 		 382 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.22 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.11 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.34 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  30.58 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  29.01 
 
 		 387 aa  165  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  30.37 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  30.49 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  32.35 
 
 		 370 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  32.49 
 
 		 417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  32.77 
 
 		 417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  32.95 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  31.02 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  30.79 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  30.41 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  28.78 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  30.08 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  33.15 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  32.88 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  29.92 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.12 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  32.52 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  32.51 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  29.48 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  30.79 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  30.03 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  28.29 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  29.41 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.01 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  29.23 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  28.85 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  28.93 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>