30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1413 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  39.53 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.11 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  39.29 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.1 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.37 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  43.42 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.96 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.74 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.56 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.94 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.04 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.23 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.88 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  32.53 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  35.29 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.86 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.04 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0334  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.73 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725093 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  30.59 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  31.03 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  28.57 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.27 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  37.88 
 
 		 276 aa  45.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  35 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  30.43 
 
 		 355 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2483  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  28.09 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  32.56 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>