38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1411 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
230 aa  458  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  34.12 
 
 
211 aa  95.1  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  27.04 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  31.76 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  28.79 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  26.53 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  28.14 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  30.99 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  25.47 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  26.98 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  27.36 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  31.43 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  31.58 
 
 
410 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  26.91 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  25.96 
 
 
237 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  30.39 
 
 
181 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  27.56 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  25.5 
 
 
237 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  28.67 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  25.7 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  29.01 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  25.36 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  32.53 
 
 
1011 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  28.38 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  28.7 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  35.11 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  24.26 
 
 
1685 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  34.12 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1057  phosphatidate cytidylyltransferase  24.41 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000000774993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  28.14 
 
 
208 aa  42  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>