58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1391 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 		 75 aa  147  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  56.52 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  51.43 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  50.72 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  54.29 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  50.72 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  50 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  56.52 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  58.46 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  57.14 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  54.93 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  59.09 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  54.41 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.15 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  44.62 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  44.62 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  47.89 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  42.86 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.54 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  39.06 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36.9 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  41.1 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.03 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  38.81 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  34.94 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.27 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.65 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  41.33 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.33 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  38.27 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  41.18 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  43.94 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  41.1 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  41.1 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.1 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  36.99 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  36.11 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.79 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  29.17 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  36.36 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  36.92 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.23 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  32.26 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  28.38 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  31.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.86 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  35.82 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  34.78 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  29.17 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  37.5 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  32.43 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  36 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  30.77 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  31.58 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>