54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1352 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  35.42 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  30.95 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  33.71 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  39.24 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  31.03 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 332 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 325 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  35 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0188  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  28.09 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  28.74 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  35.63 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  32.56 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  31.4 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  35.29 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  36.92 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  32.5 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 303 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  32.39 
 
 		 330 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  32.5 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  32.1 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  31.87 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  32.5 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  35.8 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  24.72 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>