More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1255 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
566 aa  1170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 
515 aa  283  5e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  31.1 
 
 
614 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  31.22 
 
 
615 aa  260  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
614 aa  253  5e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  9.5247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
573 aa  247  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
615 aa  244  4e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.66848e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
617 aa  241  3e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
534 aa  237  5e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 
601 aa  236  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.6301e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
516 aa  236  1e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  31.18 
 
 
516 aa  235  1e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  31.18 
 
 
516 aa  236  1e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  31.18 
 
 
516 aa  236  1e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30 
 
 
516 aa  235  2e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  31.18 
 
 
516 aa  235  2e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
501 aa  234  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.48 
 
 
535 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.8 
 
 
516 aa  229  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
501 aa  226  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  32.62 
 
 
544 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
581 aa  223  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.18 
 
 
509 aa  222  1e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
516 aa  221  4e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.26 
 
 
520 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 
544 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
521 aa  218  3e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.96 
 
 
541 aa  214  5e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.46 
 
 
521 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
521 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
617 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  5.89717e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.46 
 
 
521 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.46 
 
 
521 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
528 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.29 
 
 
521 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
499 aa  209  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.9193e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
523 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 
525 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
528 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.06 
 
 
531 aa  202  1e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  26.14 
 
 
541 aa  199  1e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
541 aa  197  4e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
527 aa  197  4e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
541 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
532 aa  194  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
518 aa  193  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
541 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
525 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
525 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
542 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.38 
 
 
532 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
576 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 
565 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 
542 aa  190  6e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
541 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
547 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 
532 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.45 
 
 
524 aa  187  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 
528 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.85 
 
 
550 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
530 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.46 
 
 
525 aa  186  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
501 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  5.33035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
531 aa  184  4e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
541 aa  184  5e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
546 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1046  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
675 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
544 aa  182  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
547 aa  181  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
535 aa  181  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
531 aa  180  5e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.18 
 
 
526 aa  180  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.32073e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
532 aa  180  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 
528 aa  180  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
534 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
534 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
531 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
531 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 
547 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
541 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
538 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
529 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
526 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
523 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
531 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
531 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
543 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
531 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.03 
 
 
531 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
531 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.4 
 
 
528 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.22 
 
 
526 aa  176  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.22 
 
 
526 aa  176  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.22 
 
 
526 aa  176  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.22 
 
 
526 aa  176  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
685 aa  175  2e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
525 aa  175  2e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.22 
 
 
526 aa  175  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 
535 aa  175  2e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
541 aa  174  6e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>