35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1246 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  100 
 
 
68 aa  141  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  48.48 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  44.78 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  43.28 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  41.79 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  43.94 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  48.44 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  47.46 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0479934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  43.08 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  50 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  50 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  47.46 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  49.21 
 
 
63 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  49.21 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  49.21 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  42.59 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0146  30S ribosomal protein S17e  46.03 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3917  Ribosomal protein S17E-like protein  47.17 
 
 
63 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  50.94 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0827  ribosomal protein S17E-like  50 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.942401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  42.59 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  46.03 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  41.07 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  45 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  40.68 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  43.4 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  44.64 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  42.86 
 
 
62 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  41.38 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  38.98 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1395  30S ribosomal protein S17e  38.71 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.407431  normal  0.322807 
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.2 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  35.59 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  37.1 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>