30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1245 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  100 
 
 		 404 aa  815    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  38.61 
 
 		 395 aa  263  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  38.42 
 
 		 390 aa  259  9e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  37.83 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  33.99 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  32.42 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  33.42 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  32.92 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  34.62 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  32.76 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  34.05 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  34.62 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  33.75 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  34.77 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  30.07 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  30.34 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  46.54 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  45.21 
 
 		 312 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  44.15 
 
 		 312 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  42.86 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  33.98 
 
 		 330 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  26.79 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  31.25 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  26.44 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  25.39 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  26.49 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  29.71 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  29.73 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  20.56 
 
 		 521 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  21.29 
 
 		 429 aa  46.6  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>