94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1146 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  100 
 
 
227 aa  453  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  35.56 
 
 
222 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  30.91 
 
 
226 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  30.91 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  30.91 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  30.91 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  30.45 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  31.86 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  30 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  30.45 
 
 
226 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  30.45 
 
 
226 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  29.55 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  29.6 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  28.18 
 
 
226 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  28.97 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  28.64 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  30.45 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  27.8 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  29.33 
 
 
224 aa  112  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  30.45 
 
 
223 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  29.86 
 
 
226 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  27.03 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  28.89 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  28.89 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  26.76 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  27.03 
 
 
226 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  26.58 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  26.36 
 
 
226 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  28.18 
 
 
226 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  28.51 
 
 
226 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  30 
 
 
195 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  24.09 
 
 
226 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  28.32 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  27.7 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  22.9 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  28.32 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  29.58 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  29.95 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  28.85 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  25.94 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  30.29 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  26.67 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  26.77 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  26.77 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  25 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  27.83 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  25.12 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  25.87 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  26.42 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  25.47 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  25.47 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  26.15 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  24.53 
 
 
214 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  24.41 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  24.53 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  24.53 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  29.3 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  23.47 
 
 
205 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  34.69 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  23.58 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  23.58 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  25.95 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  24.53 
 
 
215 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  21.74 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  25.95 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  24.64 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  23.38 
 
 
205 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  23.83 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  25.56 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  22.97 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  25.95 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  25.49 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  24.56 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  27.21 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  22.49 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  27.8 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  25.47 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  22.11 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  24.54 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  20.1 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  23.44 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  23 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  24.32 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  24.12 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  25.47 
 
 
211 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  23.61 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>