More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1131 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  64.11 
 
 
551 aa  645    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  60.59 
 
 
543 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  63.34 
 
 
555 aa  686    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  100 
 
 
539 aa  1060    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  62.41 
 
 
553 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  62.38 
 
 
542 aa  677    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  63.53 
 
 
552 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  70.42 
 
 
551 aa  728    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  64.67 
 
 
543 aa  682    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  61.49 
 
 
553 aa  647    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  62.01 
 
 
551 aa  645    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  60.8 
 
 
543 aa  620  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  60.47 
 
 
542 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  62.96 
 
 
552 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  60.47 
 
 
545 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  56.29 
 
 
554 aa  616  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  57.66 
 
 
560 aa  615  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  60.27 
 
 
542 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  56.92 
 
 
553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  56.43 
 
 
559 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  58.8 
 
 
543 aa  601  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  55.53 
 
 
557 aa  594  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  59.05 
 
 
547 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  56.43 
 
 
558 aa  594  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  57.14 
 
 
570 aa  590  1e-167  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  55.79 
 
 
545 aa  587  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  57.36 
 
 
548 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  55.47 
 
 
563 aa  578  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  58.4 
 
 
500 aa  579  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  58.32 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  57.74 
 
 
549 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  54.32 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  55.58 
 
 
559 aa  571  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  56.98 
 
 
550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  53.49 
 
 
540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  54.7 
 
 
562 aa  565  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  53.35 
 
 
552 aa  554  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  54.42 
 
 
558 aa  554  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  54.53 
 
 
560 aa  554  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  54.74 
 
 
554 aa  551  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  49.91 
 
 
558 aa  544  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  55.3 
 
 
558 aa  544  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  50.19 
 
 
554 aa  538  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  53.56 
 
 
553 aa  535  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.77 
 
 
530 aa  536  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  53.36 
 
 
529 aa  537  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  54.17 
 
 
541 aa  527  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.91 
 
 
536 aa  522  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  50.37 
 
 
561 aa  524  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.92 
 
 
527 aa  518  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.37 
 
 
532 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  49.06 
 
 
548 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.09 
 
 
555 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  47.31 
 
 
547 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.98 
 
 
537 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  46.85 
 
 
528 aa  455  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.67 
 
 
519 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.06 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.62 
 
 
546 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.33 
 
 
525 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  45.24 
 
 
535 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.48 
 
 
528 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  39.66 
 
 
538 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  44.36 
 
 
527 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  42.89 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  42.36 
 
 
529 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  38.05 
 
 
527 aa  392  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  42.59 
 
 
541 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  38.86 
 
 
570 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
567 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  40.11 
 
 
553 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  39.96 
 
 
542 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  40.11 
 
 
553 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  38.39 
 
 
559 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.19 
 
 
550 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  41.44 
 
 
536 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  40.62 
 
 
536 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  39.2 
 
 
542 aa  359  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  40.55 
 
 
533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  37.21 
 
 
577 aa  352  8e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  39.92 
 
 
548 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.6 
 
 
548 aa  347  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.94 
 
 
551 aa  346  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  37.5 
 
 
553 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  36.6 
 
 
560 aa  343  7e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.26 
 
 
558 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.85 
 
 
568 aa  336  7e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  36.21 
 
 
563 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  38.65 
 
 
530 aa  330  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  37.45 
 
 
531 aa  326  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  35.83 
 
 
539 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  35.69 
 
 
523 aa  307  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.79 
 
 
552 aa  301  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  36.45 
 
 
526 aa  296  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.84 
 
 
527 aa  296  9e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  35.32 
 
 
558 aa  293  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  31.5 
 
 
547 aa  287  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.4 
 
 
546 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.63 
 
 
541 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.47 
 
 
564 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>