More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1050 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.51 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  39.47 
 
 		 463 aa  64.3  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  28.89 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  35.25 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  33.91 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  33.91 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  33.91 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  28.79 
 
 		 469 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.58 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  28.97 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  33.61 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.36 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  33.61 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.48 
 
 		 875 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.86 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.91 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  30.65 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.69 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.79 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  29.31 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  27.73 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.01 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  32.26 
 
 		 458 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.97 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  24.57 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.45 
 
 		 863 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  24.82 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  36.57 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  24.57 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.21 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.28 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.08 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  32.54 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  29.41 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.75 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  28.32 
 
 		 455 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 902 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  32.5 
 
 		 455 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  30.43 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.57 
 
 		 888 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.23 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 		 903 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  33.64 
 
 		 459 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  31.4 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  32.11 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 487 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.76 
 
 		 845 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  26.06 
 
 		 640 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.4 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.41 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>