150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1019 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
321 aa  657    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.99 
 
 
333 aa  285  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  43.03 
 
 
326 aa  275  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  40.37 
 
 
326 aa  272  6e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.52 
 
 
327 aa  269  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  41.9 
 
 
330 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.38 
 
 
321 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.14 
 
 
330 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  40.24 
 
 
331 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.33 
 
 
330 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.91 
 
 
329 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.09 
 
 
333 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.21 
 
 
331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  39.7 
 
 
331 aa  239  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 
333 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.34 
 
 
338 aa  235  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  36.89 
 
 
330 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  37.88 
 
 
333 aa  235  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  38.73 
 
 
360 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.91 
 
 
331 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  38.11 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  41.32 
 
 
384 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  38.04 
 
 
335 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.14 
 
 
330 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  38.53 
 
 
333 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.24 
 
 
319 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  37.46 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.89 
 
 
331 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  43.63 
 
 
259 aa  222  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  35.58 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  35.47 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  36.7 
 
 
330 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  35.24 
 
 
330 aa  218  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.28 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  34.59 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  36.28 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  34.87 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.74 
 
 
328 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.1 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  30.75 
 
 
326 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.31 
 
 
545 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  26.83 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  27.3 
 
 
332 aa  125  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.03 
 
 
339 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.99 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.77 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.98 
 
 
341 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.72 
 
 
544 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.07 
 
 
343 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  25.25 
 
 
344 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
334 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.56 
 
 
343 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.9 
 
 
344 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  22.7 
 
 
325 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  23.65 
 
 
343 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  22.7 
 
 
325 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.92 
 
 
343 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  26.01 
 
 
329 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  23.62 
 
 
343 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.75 
 
 
350 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.59 
 
 
344 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  24.57 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.24 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  22.09 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.84 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  23.64 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.16 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  23.21 
 
 
346 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.24 
 
 
598 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  22.82 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  23.55 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.72 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.51 
 
 
344 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  24.86 
 
 
344 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  23.85 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  23.57 
 
 
594 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.49 
 
 
580 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.75 
 
 
338 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.28 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.12 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  25.58 
 
 
558 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.17 
 
 
570 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  21.68 
 
 
343 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  23.28 
 
 
323 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  24.55 
 
 
346 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25 
 
 
559 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  21.09 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  25.82 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  22.61 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  23.27 
 
 
553 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.18 
 
 
550 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  24.27 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  24.54 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.44 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  21.92 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.77 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.12 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  22.37 
 
 
727 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  20.72 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>