50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1011 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  100 
 
 		 460 aa  922    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  30 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  28.91 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  27.25 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  28.61 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  28.01 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  28.36 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  29.1 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  28.8 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  25.96 
 
 		 426 aa  113  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  26.81 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  28.74 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.16 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.43 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  27.03 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  25.58 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.95 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  25.14 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  26.3 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  26.29 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  26.99 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  25.28 
 
 		 429 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.63 
 
 		 383 aa  96.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.14 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  29.89 
 
 		 288 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  23.98 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.47 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.71 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  28.64 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.61 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  26.56 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  37.23 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  28.85 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.13 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.47 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0783  5-methylcytosine restriction system component- like protein  26.57 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  47.62 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1283  5-methylcytosine restriction system component- like protein  26.61 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000503694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  27.01 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0879  hypothetical protein  26.13 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0515666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.31 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.51 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0225  conserved hypothetical protein, putative endonuclease  50 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.131581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  23.4 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4768  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.76 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.393001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2863  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.44 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0952  hypothetical protein  27.32 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04175  hypothetical protein  26.46 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04211  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC  26.46 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3652  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  26.06 
 
 		 348 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>