146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0922 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 607 aa  1221    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  31.3 
 
 		 783 aa  251  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  30.78 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  31.27 
 
 		 785 aa  244  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  31.21 
 
 		 780 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  31.21 
 
 		 783 aa  234  5e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  31.49 
 
 		 780 aa  231  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  30.6 
 
 		 784 aa  229  8e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  31.49 
 
 		 781 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  28.87 
 
 		 781 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  31.38 
 
 		 810 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.79 
 
 		 794 aa  201  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  29.13 
 
 		 811 aa  193  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  27.62 
 
 		 784 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  24.07 
 
 		 932 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  26.84 
 
 		 853 aa  142  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  26.55 
 
 		 871 aa  136  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  28.37 
 
 		 854 aa  135  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  25.57 
 
 		 785 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  25.8 
 
 		 854 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  27.66 
 
 		 853 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  25.25 
 
 		 882 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  29.48 
 
 		 1485 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  26.14 
 
 		 835 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  25.3 
 
 		 792 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  26.62 
 
 		 912 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  24.79 
 
 		 811 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  22.35 
 
 		 783 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  26.26 
 
 		 795 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  22.35 
 
 		 783 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  24.86 
 
 		 818 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.07 
 
 		 783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.07 
 
 		 783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  24.32 
 
 		 796 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  22.35 
 
 		 783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  22.19 
 
 		 783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.3 
 
 		 783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.87 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.87 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.87 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.87 
 
 		 783 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  22.44 
 
 		 793 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  22.78 
 
 		 794 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  22.78 
 
 		 794 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  22.95 
 
 		 794 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.87 
 
 		 783 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 790 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  22.35 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.66 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  25.74 
 
 		 723 aa  112  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  28 
 
 		 1459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 786 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  25.88 
 
 		 929 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  25.96 
 
 		 877 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 807 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.84 
 
 		 792 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22.58 
 
 		 788 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  22.47 
 
 		 787 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25 
 
 		 852 aa  108  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  27.58 
 
 		 812 aa  108  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  24.14 
 
 		 796 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.48 
 
 		 794 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  25.39 
 
 		 1463 aa  107  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 816 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  22.2 
 
 		 816 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  21.9 
 
 		 786 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  24.26 
 
 		 910 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  21.91 
 
 		 788 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  22.81 
 
 		 788 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  23.9 
 
 		 789 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  21.9 
 
 		 786 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 791 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  24.18 
 
 		 793 aa  104  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  22.24 
 
 		 791 aa  104  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  25.48 
 
 		 1353 aa  104  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 787 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  25.57 
 
 		 743 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  22.22 
 
 		 787 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  27.36 
 
 		 821 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  28.85 
 
 		 990 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  21.47 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  22.06 
 
 		 787 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.24 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  22.75 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  22.96 
 
 		 818 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  22.39 
 
 		 788 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  22.54 
 
 		 790 aa  100  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  22.41 
 
 		 787 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  21.7 
 
 		 786 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  21.7 
 
 		 786 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  22.35 
 
 		 789 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  23.2 
 
 		 657 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  21.93 
 
 		 820 aa  99.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  23.57 
 
 		 790 aa  99.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  21.45 
 
 		 789 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  22.26 
 
 		 800 aa  98.2  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  22.09 
 
 		 788 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  21.45 
 
 		 789 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.42 
 
 		 799 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>