178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0855 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  100 
 
 		 802 aa  1557    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  30.88 
 
 		 806 aa  278  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  30.12 
 
 		 862 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.03 
 
 		 804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  25.7 
 
 		 864 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  25.33 
 
 		 891 aa  124  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.5 
 
 		 993 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  23.63 
 
 		 888 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25.38 
 
 		 924 aa  98.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.51 
 
 		 702 aa  96.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.25 
 
 		 702 aa  96.3  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.22 
 
 		 890 aa  95.5  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  22.69 
 
 		 702 aa  95.9  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  25.89 
 
 		 891 aa  94.7  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.31 
 
 		 1021 aa  94.7  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.86 
 
 		 926 aa  85.5  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  22.7 
 
 		 858 aa  84.3  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.02 
 
 		 895 aa  83.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.1 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  28.71 
 
 		 693 aa  81.3  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  23.01 
 
 		 987 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.11 
 
 		 1038 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.28 
 
 		 993 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 993 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  19.82 
 
 		 814 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  22.42 
 
 		 987 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.93 
 
 		 813 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  23.13 
 
 		 902 aa  74.7  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 994 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.23 
 
 		 1029 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  23.96 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  25.42 
 
 		 1019 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  21.61 
 
 		 812 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.58 
 
 		 1029 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.56 
 
 		 1029 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.56 
 
 		 1029 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.73 
 
 		 1029 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.86 
 
 		 953 aa  67  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.34 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  23.29 
 
 		 1019 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.82 
 
 		 978 aa  67.4  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  25.11 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.13 
 
 		 935 aa  66.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1164 aa  66.6  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  30.54 
 
 		 1049 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.41 
 
 		 1074 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.17 
 
 		 1029 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  24.66 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.31 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  24.89 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 852 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 852 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  20.06 
 
 		 1008 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  23.83 
 
 		 1029 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  37.5 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  22.2 
 
 		 1031 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  31.03 
 
 		 1003 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  28.75 
 
 		 1081 aa  58.9  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  23.78 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  23.22 
 
 		 984 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  25.2 
 
 		 790 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 		 1177 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  20.59 
 
 		 906 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  20.03 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  26.91 
 
 		 910 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25.78 
 
 		 1046 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.3 
 
 		 904 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  24.29 
 
 		 1099 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1170 aa  52.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  34.83 
 
 		 1033 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1170 aa  52.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  22.99 
 
 		 1175 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.47 
 
 		 1116 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  31.82 
 
 		 1057 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  29.67 
 
 		 261 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.44 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  21.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 		 1196 aa  51.2  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  28.81 
 
 		 1022 aa  50.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  23.48 
 
 		 657 aa  50.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  21.91 
 
 		 1016 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  31.87 
 
 		 1188 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  37.76 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  23.09 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1234 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.09 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32.54 
 
 		 1018 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  35.09 
 
 		 664 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  32.06 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  20.27 
 
 		 1007 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  34.15 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  32.58 
 
 		 557 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  32.48 
 
 		 1182 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.48 
 
 		 1176 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  26.05 
 
 		 1217 aa  49.3  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  31.82 
 
 		 533 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  26.76 
 
 		 1115 aa  49.3  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1153 aa  49.3  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  28.36 
 
 		 1997 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  37.08 
 
 		 962 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>