More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0749 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  100 
 
 
405 aa  794    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  62.87 
 
 
405 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.14 
 
 
467 aa  362  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.26 
 
 
405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.52 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  46.02 
 
 
410 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46.02 
 
 
410 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  45.77 
 
 
410 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.77 
 
 
411 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  45.77 
 
 
410 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.02 
 
 
410 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.52 
 
 
410 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  45.52 
 
 
410 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  45.91 
 
 
449 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  45.52 
 
 
410 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.41 
 
 
457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.76 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  45.79 
 
 
453 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  46.77 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  45.64 
 
 
438 aa  339  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.05 
 
 
461 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  45.05 
 
 
451 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  44.8 
 
 
402 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  43.56 
 
 
462 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46.13 
 
 
436 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  44.28 
 
 
427 aa  325  9e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.67 
 
 
398 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  43.35 
 
 
462 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  44.2 
 
 
397 aa  323  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.27 
 
 
402 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  43.75 
 
 
397 aa  323  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  46.4 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.12 
 
 
428 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  43.07 
 
 
406 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  44.23 
 
 
429 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  42.13 
 
 
435 aa  317  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  43.45 
 
 
418 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.4 
 
 
408 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  45.07 
 
 
427 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  45.66 
 
 
464 aa  316  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  43.92 
 
 
443 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  46.4 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.87 
 
 
515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1299  ammonium transporter  44.47 
 
 
412 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.421181  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  42.08 
 
 
448 aa  312  4.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1461  ammonium transporter  44.47 
 
 
412 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  45.79 
 
 
470 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  44.44 
 
 
442 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  45.16 
 
 
401 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.4 
 
 
515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  42.33 
 
 
399 aa  309  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  41.98 
 
 
402 aa  309  5e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  43.35 
 
 
438 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  43.35 
 
 
438 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  42.12 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  44.44 
 
 
429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5122  ammonium transporter  45.04 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  42.4 
 
 
434 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  42.47 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  41.87 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  43.31 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  43.31 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  43.31 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  43.31 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  43.31 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  43.31 
 
 
444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  43.31 
 
 
478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.52 
 
 
438 aa  302  6.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  41.94 
 
 
400 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.16 
 
 
488 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  45.81 
 
 
401 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  44.23 
 
 
456 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  44.96 
 
 
478 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  42.82 
 
 
469 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  44.19 
 
 
470 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.31 
 
 
504 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  44.36 
 
 
432 aa  299  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  43.51 
 
 
439 aa  299  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  44.44 
 
 
433 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.07 
 
 
501 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  43.41 
 
 
499 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  44.83 
 
 
402 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  42.82 
 
 
500 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  43.07 
 
 
500 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  43.07 
 
 
500 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  43.07 
 
 
500 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  42.17 
 
 
461 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  41.85 
 
 
436 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  42.45 
 
 
485 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  43.35 
 
 
435 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  40.15 
 
 
431 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  43.07 
 
 
431 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  44.98 
 
 
474 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  43.89 
 
 
433 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  42.2 
 
 
521 aa  292  8e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  41.4 
 
 
489 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  42.68 
 
 
502 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  43.38 
 
 
413 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  42.76 
 
 
472 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  41.51 
 
 
496 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>