More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0657 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  100 
 
 
237 aa  483  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  61.71 
 
 
227 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  62.44 
 
 
222 aa  279  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  59.82 
 
 
241 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  59.19 
 
 
224 aa  274  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  59.64 
 
 
225 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  60.99 
 
 
225 aa  268  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  59.73 
 
 
244 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  60.09 
 
 
228 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  59.11 
 
 
226 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  60.54 
 
 
224 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  60.09 
 
 
224 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  57.52 
 
 
230 aa  265  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  60.09 
 
 
224 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  58.82 
 
 
233 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  61.78 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  60.18 
 
 
222 aa  264  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  60.09 
 
 
225 aa  264  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  59.64 
 
 
224 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  57.52 
 
 
230 aa  264  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  58.67 
 
 
244 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  59.64 
 
 
224 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  60.09 
 
 
224 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  59.64 
 
 
224 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  59.19 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  57.21 
 
 
221 aa  261  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  58.3 
 
 
229 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  57.85 
 
 
226 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  56.95 
 
 
228 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  60.89 
 
 
237 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  57.96 
 
 
232 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  58.3 
 
 
224 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  57.33 
 
 
226 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  59.64 
 
 
229 aa  258  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  59.11 
 
 
227 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  57.85 
 
 
229 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  59.19 
 
 
223 aa  255  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  56.05 
 
 
230 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  59.38 
 
 
226 aa  254  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  57.33 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  59.64 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  56.7 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  58.74 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  54.82 
 
 
229 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  57.33 
 
 
234 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  57.33 
 
 
234 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  54.91 
 
 
228 aa  250  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  56.31 
 
 
224 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  58.3 
 
 
227 aa  249  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  56.25 
 
 
224 aa  248  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  54.91 
 
 
227 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  55.36 
 
 
229 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  55.36 
 
 
223 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  55.36 
 
 
228 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  55.36 
 
 
228 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  57.66 
 
 
224 aa  245  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  56.62 
 
 
235 aa  244  6.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  56.19 
 
 
232 aa  244  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  56.39 
 
 
246 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  55.56 
 
 
233 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  56.25 
 
 
234 aa  241  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  53.12 
 
 
233 aa  241  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  54.38 
 
 
230 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  54.59 
 
 
229 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  58.3 
 
 
224 aa  238  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  52.53 
 
 
225 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  52.07 
 
 
225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  53.15 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  53.68 
 
 
256 aa  232  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  52.91 
 
 
229 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  52.91 
 
 
229 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  50.43 
 
 
259 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  50.64 
 
 
285 aa  229  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  54.9 
 
 
224 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  53.67 
 
 
224 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  53.67 
 
 
224 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  53.64 
 
 
236 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  49.54 
 
 
229 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  51.61 
 
 
231 aa  223  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  50.44 
 
 
221 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  48.94 
 
 
251 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  52.15 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  49.3 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  49.3 
 
 
225 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  51.58 
 
 
233 aa  217  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  49.31 
 
 
226 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  50 
 
 
227 aa  215  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  46.4 
 
 
218 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  45.05 
 
 
219 aa  208  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  49.34 
 
 
226 aa  208  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  48.36 
 
 
484 aa  207  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  47.75 
 
 
218 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  46.29 
 
 
229 aa  205  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  45.26 
 
 
243 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  49.07 
 
 
226 aa  204  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  48.43 
 
 
221 aa  204  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  47.62 
 
 
258 aa  204  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  46.29 
 
 
227 aa  203  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  49.11 
 
 
220 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  46.22 
 
 
222 aa  202  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>