More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0595 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  218  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  40.95 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  43.52 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  40.19 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  33.94 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  37.38 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  37.86 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  40.86 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  40.82 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  36.45 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  35.58 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  36.54 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  27.72 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  36.54 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  37.37 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  35.58 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  35.19 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  46.84 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  32.17 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  31.37 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  35.78 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  30.1 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  38.83 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.67 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  30.84 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.67 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  31.13 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>