More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0578 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 395 aa  798    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  44.44 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  42.26 
 
 		 391 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  43.18 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  41.12 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  44.9 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  43.22 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  44.05 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  41.92 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  44.05 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  39.85 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  37.75 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  38.29 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  36.75 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  37.94 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  34.22 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  33.33 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  28.61 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.83 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.4 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 453 aa  136  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.93 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  29.81 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  34.8 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 452 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.8 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.05 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.64 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 385 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.11 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  33.55 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  33.55 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 485 aa  90.5  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 455 aa  89.7  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.75 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.81 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  26.55 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.51 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>