55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0571 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  32.92 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  32.08 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  32.9 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  33.77 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  37.75 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  31.29 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.7 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  28.85 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  27.11 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  31.41 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  27.71 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  30.43 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  28.75 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  29.27 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  30.49 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  30.25 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  28.66 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  29.49 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  29.01 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  29.49 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  30.12 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  26.25 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  28.05 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  28.8 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  28.85 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  26.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  28.03 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  27.38 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  26.25 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  27.16 
 
 		 220 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  29.03 
 
 		 201 aa  51.2  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  24.58 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  31.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.3 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  29.01 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  28.16 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  27.44 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  26.14 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  27.37 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  25.29 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  28.3 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  26.42 
 
 		 236 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  23.75 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  25.64 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  26.63 
 
 		 205 aa  44.3  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  24.38 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  29.31 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  25.29 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  26.16 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  27.56 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  25.83 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  31.45 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  29.41 
 
 		 233 aa  40.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>