More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0536 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
351 aa  716    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  55.17 
 
 
356 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  52.59 
 
 
357 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.16 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  351  8e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 
359 aa  349  4e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  49.15 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50 
 
 
359 aa  335  7e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  48.58 
 
 
353 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  48.01 
 
 
352 aa  335  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.75 
 
 
354 aa  324  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  47.16 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  46.88 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  46.97 
 
 
360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.69 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 
351 aa  267  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 
354 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 
347 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.33 
 
 
358 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 
342 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 
338 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 
342 aa  222  7e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.54 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  35.35 
 
 
334 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.05 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  41.6 
 
 
334 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.25 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.41 
 
 
334 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
349 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 
355 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  33.67 
 
 
352 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.33 
 
 
352 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.79 
 
 
356 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  31.8 
 
 
351 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.41 
 
 
357 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.2 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.93 
 
 
353 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.4 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
403 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  29.29 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  36.63 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  29.04 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.41 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  32.03 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.27 
 
 
454 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.49 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  29.58 
 
 
419 aa  101  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.41 
 
 
403 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  30.3 
 
 
418 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.88 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.68 
 
 
423 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.52 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.6 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  25.72 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  29.27 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  29.27 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  26.83 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  25.91 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  25.87 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  24.92 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.14 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.4 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.3 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  25.18 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  25.18 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  24.04 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  25.19 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  25.18 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  25.98 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  23.3 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  24.2 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  29.89 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  26.79 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  23.64 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  22.6 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.49 
 
 
367 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  26.73 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.41 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  23.66 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  24.46 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.19 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  25.88 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  25.29 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  30.31 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  26.61 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.01 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  26.22 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  26.23 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.53 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.09 
 
 
384 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  27.73 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>