More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0529 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
417 aa  857  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  43.19 
 
 
418 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  40.92 
 
 
399 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 
442 aa  283  5e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  35.58 
 
 
432 aa  276  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 
431 aa  275  1e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  35.78 
 
 
431 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  9.05056e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 
443 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  35.7 
 
 
450 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  33.79 
 
 
427 aa  249  7e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  33.63 
 
 
451 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  36 
 
 
446 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  36 
 
 
446 aa  245  1e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  35.92 
 
 
439 aa  243  4e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.45 
 
 
446 aa  240  3e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  35.73 
 
 
458 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  35.67 
 
 
446 aa  233  6e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  34.03 
 
 
436 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.71 
 
 
453 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  33.93 
 
 
471 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  33.71 
 
 
444 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 
427 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  31.47 
 
 
452 aa  221  2e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  32.54 
 
 
472 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  33.41 
 
 
457 aa  219  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  32.14 
 
 
439 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  33.71 
 
 
470 aa  219  8e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  30.89 
 
 
447 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  32.55 
 
 
438 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  32.07 
 
 
474 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  32.37 
 
 
456 aa  216  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  33.33 
 
 
449 aa  213  4e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 
413 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  30.45 
 
 
458 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  31.6 
 
 
443 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  31.03 
 
 
478 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  31.14 
 
 
474 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  30.91 
 
 
476 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  33.49 
 
 
446 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  32.07 
 
 
440 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  32.28 
 
 
388 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
447 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  31.29 
 
 
443 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  30.88 
 
 
419 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  32.2 
 
 
457 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  32.05 
 
 
448 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  31.66 
 
 
494 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  31.52 
 
 
452 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  30.72 
 
 
451 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  30.89 
 
 
444 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  30.48 
 
 
451 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  31.42 
 
 
443 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  32.65 
 
 
457 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 
437 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  31 
 
 
463 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  30.02 
 
 
451 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  33.03 
 
 
472 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  30.02 
 
 
451 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.75 
 
 
407 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  31.1 
 
 
465 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
411 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  30.46 
 
 
494 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  32.04 
 
 
482 aa  201  2e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  30.93 
 
 
448 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  31.49 
 
 
468 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  34.42 
 
 
450 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  31.79 
 
 
452 aa  200  4e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  31.84 
 
 
470 aa  200  4e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 
486 aa  200  4e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  7.39457e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  32.72 
 
 
453 aa  200  4e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  30.91 
 
 
459 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  29.93 
 
 
484 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  34.09 
 
 
468 aa  199  1e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.53 
 
 
463 aa  198  1e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  32.45 
 
 
469 aa  199  1e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  31.21 
 
 
455 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  29.44 
 
 
462 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  29.35 
 
 
500 aa  196  8e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  27.9 
 
 
478 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  33.56 
 
 
443 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 
489 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  30.95 
 
 
433 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  31.29 
 
 
470 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  31.29 
 
 
470 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  31.04 
 
 
458 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  32.73 
 
 
457 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  30.17 
 
 
401 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  32.03 
 
 
464 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  31.81 
 
 
447 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 
517 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 
443 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
478 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  28.38 
 
 
467 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  31.43 
 
 
459 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  31.97 
 
 
436 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  29.15 
 
 
435 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  28.23 
 
 
487 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  30.75 
 
 
440 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  29.33 
 
 
460 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  29.96 
 
 
488 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>