55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0505 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
147 aa  279  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  37.86 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  41.5 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  37.09 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  30.99 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.99 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  29.86 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  29.58 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  28.87 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  31.21 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
151 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  28.91 
 
 
118 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  27.41 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  30.22 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 
430 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  30.22 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  30.28 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  30.37 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.15 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  27.81 
 
 
473 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  28.77 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.84 
 
 
144 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  28.08 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  27.66 
 
 
460 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  26.03 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  31.17 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  27.4 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  34.07 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  26.61 
 
 
433 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  27.4 
 
 
429 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  25.18 
 
 
451 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  27.67 
 
 
428 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  28.12 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2991  protein of unknown function DUF107  31.69 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  25.66 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  25.66 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  25.66 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  25 
 
 
439 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  25.74 
 
 
488 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  29.58 
 
 
455 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>