More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0419 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  100 
 
 
313 aa  627  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.54 
 
 
335 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.18 
 
 
335 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 
330 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.3 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.3 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  27.99 
 
 
330 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 
350 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.3 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  30.06 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.9 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.08 
 
 
337 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.73 
 
 
332 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 
336 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 
351 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  29.85 
 
 
337 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.77 
 
 
347 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 
395 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 
562 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  22.26 
 
 
567 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 
350 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.23 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
397 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.64 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  23.57 
 
 
542 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
388 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.38 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  30.17 
 
 
399 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 
341 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  26.93 
 
 
339 aa  85.9  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.08 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.69 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.45 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  26.45 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  26.2 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.39 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  23.47 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  25.31 
 
 
564 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  26.37 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  24.62 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.71 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  23.85 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  23.85 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  23.85 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  23.85 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  24.24 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  22.77 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  24.06 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  24.44 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  23.71 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  22.86 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.26 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.16 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.21 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.74 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  23.46 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  23.15 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  23.01 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  21.52 
 
 
544 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  25.2 
 
 
416 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  24.09 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  22.87 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.93 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  27.8 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.58 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.17 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.38 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  24.62 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.15 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.52 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.52 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  31.29 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.07 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.52 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  24.88 
 
 
568 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  26.6 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  26.6 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.32 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  26.6 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 
664 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  27.05 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  21.91 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  24.83 
 
 
355 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  25.36 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  25.36 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  25.36 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  20.49 
 
 
569 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>