299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0309 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  46.74 
 
 
276 aa  266  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  43.01 
 
 
277 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  42.75 
 
 
277 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  42.16 
 
 
281 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  41.49 
 
 
283 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  42.86 
 
 
277 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  42.86 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  44.36 
 
 
279 aa  236  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  40.07 
 
 
275 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  43.02 
 
 
279 aa  234  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  43.27 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  39.27 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  39.49 
 
 
283 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  41.97 
 
 
291 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  38.85 
 
 
284 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  39.57 
 
 
280 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  44.12 
 
 
279 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  39.13 
 
 
283 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  42.28 
 
 
273 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  39.57 
 
 
280 aa  228  7e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  38.85 
 
 
280 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  38.49 
 
 
286 aa  226  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  41.73 
 
 
287 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  43.84 
 
 
296 aa  222  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  41.26 
 
 
283 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  42.65 
 
 
302 aa  221  8e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  38.93 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  43.48 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  39.49 
 
 
287 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  39.72 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  38.04 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  39.86 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  40.94 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  40.74 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  41.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  42.18 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  40.07 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  39.71 
 
 
286 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  39.71 
 
 
286 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  39.71 
 
 
286 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  38.1 
 
 
289 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  37.37 
 
 
278 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  39.71 
 
 
286 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  38.55 
 
 
285 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  40.58 
 
 
288 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  39.27 
 
 
275 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  38.85 
 
 
289 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  38.18 
 
 
285 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  38.91 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  39.27 
 
 
275 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  39.49 
 
 
296 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  39.49 
 
 
296 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  39.49 
 
 
296 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  38.18 
 
 
283 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  39.57 
 
 
287 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  38.55 
 
 
275 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  38.97 
 
 
284 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  40.51 
 
 
283 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  37.91 
 
 
283 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  40.71 
 
 
295 aa  202  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  36.65 
 
 
287 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  37.18 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  39.33 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  37.45 
 
 
278 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  36.86 
 
 
292 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  37.09 
 
 
285 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  37.16 
 
 
299 aa  199  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  37.83 
 
 
286 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  38.58 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  38.24 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  35.97 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  40.07 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  36.36 
 
 
283 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  35.74 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  38.2 
 
 
286 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  35.16 
 
 
286 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  36.65 
 
 
289 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  40.08 
 
 
278 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  38.95 
 
 
748 aa  192  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  40.08 
 
 
316 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  37.45 
 
 
286 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  42.8 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0073  spermidine synthase  35.4 
 
 
286 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  38.11 
 
 
316 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  36.58 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>