More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0197 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  44.84 
 
 
873 aa  712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  47.4 
 
 
875 aa  779    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  41.03 
 
 
872 aa  644    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 
1688 aa  3424    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  41.87 
 
 
874 aa  649    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  40.77 
 
 
915 aa  639    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  46.36 
 
 
870 aa  749    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  42.63 
 
 
874 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  41.98 
 
 
874 aa  650    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  48.86 
 
 
888 aa  835    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  42.2 
 
 
872 aa  694    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  41.15 
 
 
922 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  40.05 
 
 
914 aa  625  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  37.87 
 
 
941 aa  591  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  38.71 
 
 
1523 aa  562  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  36.39 
 
 
1435 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.75 
 
 
1480 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.44 
 
 
1518 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  36.01 
 
 
1573 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 
1508 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.02 
 
 
1505 aa  539  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  36.93 
 
 
1504 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  38.1 
 
 
1388 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.43 
 
 
1497 aa  536  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.42 
 
 
1426 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  36.42 
 
 
1434 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
1429 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.07 
 
 
1510 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.1 
 
 
1475 aa  530  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  38.05 
 
 
1419 aa  526  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
1451 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.98 
 
 
1448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  36.95 
 
 
1448 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.34 
 
 
1412 aa  513  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  35.71 
 
 
1431 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.15 
 
 
1534 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  35.5 
 
 
1480 aa  503  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  32.18 
 
 
1523 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.22 
 
 
900 aa  483  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.3 
 
 
1553 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  32.47 
 
 
1567 aa  478  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  42.74 
 
 
1515 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  42.59 
 
 
1598 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.59 
 
 
1598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  42.59 
 
 
1598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.59 
 
 
1700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 
1517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  42.59 
 
 
1599 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.44 
 
 
1523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.59 
 
 
1598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.59 
 
 
1598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.08 
 
 
1626 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  33.95 
 
 
1531 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  33.44 
 
 
1523 aa  466  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 
1516 aa  466  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.44 
 
 
1523 aa  466  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.56 
 
 
1514 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  34.43 
 
 
1495 aa  466  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  32.08 
 
 
1544 aa  466  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.57 
 
 
1493 aa  466  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.1 
 
 
1538 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
1613 aa  463  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  33.52 
 
 
1536 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  32 
 
 
1525 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  33.44 
 
 
1536 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  32 
 
 
1538 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  32 
 
 
1538 aa  457  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  32 
 
 
1538 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.89 
 
 
1538 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.1 
 
 
1538 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  32 
 
 
1538 aa  457  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  33.52 
 
 
1536 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  33.3 
 
 
1644 aa  452  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  32.89 
 
 
1584 aa  454  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.99 
 
 
1535 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 
1539 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  32.31 
 
 
1549 aa  440  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.02 
 
 
1561 aa  436  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 
1476 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  30.76 
 
 
1601 aa  436  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  32.37 
 
 
1513 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.89 
 
 
1502 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  28.77 
 
 
1729 aa  429  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  32.3 
 
 
1572 aa  429  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  31.31 
 
 
1741 aa  427  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.14 
 
 
1506 aa  426  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  30.21 
 
 
1618 aa  427  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  32.16 
 
 
1509 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  31.18 
 
 
1606 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  29.66 
 
 
1632 aa  411  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  30.21 
 
 
1694 aa  410  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
1694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 
932 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
1381 aa  406  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.52 
 
 
927 aa  396  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  31.8 
 
 
943 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  30.24 
 
 
1649 aa  390  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.85 
 
 
928 aa  384  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  31.85 
 
 
955 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  33 
 
 
898 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>