More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0182 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  59.48 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  57.2 
 
 		 245 aa  281  9e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  56.72 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  53.04 
 
 		 501 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  55.17 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  51.85 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  53.68 
 
 		 343 aa  265  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  51.9 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  50.22 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  50 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  52.16 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  53.02 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  30.38 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  28.57 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  31.15 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  29.83 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  29.06 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  26.21 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  29.41 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  28.99 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  29.54 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  30.8 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  27.62 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  30.29 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  31.45 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  27.62 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.77 
 
 		 703 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  29.27 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  29.84 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.35 
 
 		 699 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  32.51 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  29.05 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  29.29 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  29.54 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.19 
 
 		 693 aa  92.8  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  29.17 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  29.29 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  29.74 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  27.73 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  28.27 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  28.33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  29.29 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  31.28 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  31.28 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.19 
 
 		 772 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  29.75 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.64 
 
 		 736 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  27.2 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  36.3 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  28.33 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  27.5 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  27.5 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  28.39 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  28.93 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.38 
 
 		 693 aa  88.6  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.51 
 
 		 699 aa  88.6  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  29.46 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  29.46 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.75 
 
 		 708 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  25.1 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  27.97 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.75 
 
 		 708 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  27.92 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  28.4 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  28.46 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  27.5 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  28.33 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.46 
 
 		 725 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  30 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0369  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.19 
 
 		 717 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  30 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  30 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  30 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  30 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  26.38 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  27.9 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  31.91 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  29.06 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0288  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.88 
 
 		 730 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0388227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  26.45 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  27.62 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  29.38 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.22 
 
 		 752 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  30.58 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  27.47 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  27.5 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>