16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0173 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1474  ABC-2 type transporter  36.32 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2151  ABC-2 type transport system, membrane protein  28.29 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.148287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1969  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000398406  hitchhiker  0.000000000710377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1079  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0486058 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0220  ABC-2 type transport system, membrane protein  25.52 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0612371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0349  hypothetical protein  26.35 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1779  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.496998  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.72 
 
 		 356 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.4 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1211  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0428455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  25.64 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 281 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>