65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0133 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  100 
 
 
462 aa  939    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  36.47 
 
 
478 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  35.94 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  35.06 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  35.06 
 
 
456 aa  242  9e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  33.69 
 
 
476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  34.21 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  33.26 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  31.5 
 
 
463 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  30.55 
 
 
462 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  33.41 
 
 
457 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  32.82 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  30.54 
 
 
454 aa  208  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  32.84 
 
 
464 aa  207  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  31.91 
 
 
464 aa  207  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  30.02 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  35.21 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  30.88 
 
 
464 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  30.56 
 
 
456 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  34.55 
 
 
431 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  32.43 
 
 
474 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  31.79 
 
 
458 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  29.65 
 
 
469 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  31.01 
 
 
463 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  29.25 
 
 
473 aa  192  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  28.94 
 
 
496 aa  183  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  34.64 
 
 
439 aa  180  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  28.26 
 
 
460 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  31.86 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  27.62 
 
 
463 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  26.87 
 
 
471 aa  166  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  28.17 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  29.91 
 
 
443 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  28.22 
 
 
469 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  30.32 
 
 
420 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  34.78 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  27.43 
 
 
472 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  26.53 
 
 
470 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  27.12 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  25.32 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  29.3 
 
 
407 aa  107  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.67 
 
 
475 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  24.24 
 
 
509 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  26.7 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.45 
 
 
480 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  28.51 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  25.6 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  30.87 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  30.46 
 
 
307 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  22.61 
 
 
277 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.96 
 
 
474 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  24.29 
 
 
498 aa  60.1  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  26.53 
 
 
279 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  24.84 
 
 
304 aa  57.4  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  25.73 
 
 
304 aa  56.6  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  24.69 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  25.2 
 
 
292 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  25.98 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  25.2 
 
 
273 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  23.9 
 
 
383 aa  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  23.58 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  28.78 
 
 
356 aa  47.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  23.05 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  25.4 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  22.7 
 
 
471 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>