More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0086 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
385 aa  786    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
382 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 
381 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 
383 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 
382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.44 
 
 
386 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
500 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
496 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
500 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 
388 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 
385 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
376 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
378 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 
392 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
373 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
385 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
385 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 
387 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
413 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  28.35 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
413 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
823 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
816 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  29.63 
 
 
417 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.65 
 
 
431 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
816 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
395 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
383 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
383 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
383 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
365 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.25 
 
 
414 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  29.82 
 
 
416 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  29.82 
 
 
416 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
394 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
389 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
393 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  30.75 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.23 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.98 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.8 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.76 
 
 
417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.63 
 
 
417 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
413 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.63 
 
 
417 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.65 
 
 
406 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  28.35 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.35 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.8 
 
 
417 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.6 
 
 
414 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.29 
 
 
416 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  26.52 
 
 
408 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.84 
 
 
417 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
385 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  28.88 
 
 
417 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
382 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.41 
 
 
460 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  26.24 
 
 
412 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  28.06 
 
 
414 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.42 
 
 
406 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.15 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.5 
 
 
417 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.12 
 
 
418 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
388 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.07 
 
 
417 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
388 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
819 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.58 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
442 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3774  sarcosine oxidase beta subunit  28.42 
 
 
417 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.55 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
374 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
817 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.55 
 
 
417 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
396 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.55 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.38 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1101  sarcosine oxidase subunit beta  27.55 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.32 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>