26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0076 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0076  Translin  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  41.49 
 
 
223 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  35.78 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  37.44 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.99 
 
 
231 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  33.33 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  37.06 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.96 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  33.33 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.77 
 
 
208 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  29.95 
 
 
217 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.76 
 
 
210 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.57 
 
 
204 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.92 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  35.39 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  32 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.83 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.27 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.46 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  31.74 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.68 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.76 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.22 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.43 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.93 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43976  predicted protein  25.14 
 
 
492 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>